想必大家都會(huì)有這樣的一個(gè)疑問(wèn),RNA提取過(guò)程中試劑的作用是什么呢?下面就跟著上海東寰一起來(lái)看看吧。
氯仿是分子量比較大的有機(jī)溶劑,在提取RNA時(shí),氯仿可以有效的使有機(jī)相和無(wú)機(jī)相迅速分離。RNA提取過(guò)程,有機(jī)相中主要是酚和蛋白結(jié)合,從而使得蛋白和RNA脫離,RNA進(jìn)入水相。下面就由 氯仿的作用有多個(gè)方面,加入氯仿,雖然有變性蛋白質(zhì)的作用,但是其主要用處是用來(lái)分相,實(shí)際上是加速有機(jī)相和水相的分層。
一般的trizol試劑在4度下是油狀懸浮液,提高溫度,放置一段時(shí)間,自然也會(huì)分相。離心后混合物分成三層:下層苯酚-氯仿層,中間層,上層無(wú)色的水樣層。RNA無(wú)一例外地存在于水樣層當(dāng)中。水樣層的容量大約為400ul?!緲?biāo)準(zhǔn):1mlTrizol加200ul的氯仿,水樣層的容量大約為所加Trizol 容量的60% 】 上層水相,PH 5.1左右,當(dāng)溶液pH在酸性的時(shí)候,RNA分子就會(huì)沉淀在酚與溶液的界面,只有RNA分子留在水相。而當(dāng)pH接近中性時(shí),RNA就會(huì)溶解在水相,(導(dǎo)致PH中性的大概原因是trizol與樣品比例不對(duì),應(yīng)該盡量保證提取量的前提下使trizol過(guò)量) Trizol法提RNA,加氯仿就是要?jiǎng)×艺鹗幉判?,這樣才能徹底地兩相混勻。
異丙醇的作用是通過(guò)-OH的疏水作用使得RNA鏈中的親水基團(tuán)受到保護(hù),等同于沉淀,但是這是個(gè)反應(yīng)時(shí)發(fā)生在水相中,與前面的氯仿不矛盾。通過(guò)將水樣層和異丙醇混合來(lái)沉淀RNA, RNA沉淀在離心前通常不可見(jiàn),形成一膠狀片狀沉淀附著于試管壁和管底。 異丙醇是沉淀核酸用的,作用和乙醇一樣。只不過(guò)用量少一點(diǎn),0.6V~1V就夠了,在水相很多,離心管容積有限,加不下太多乙醇的時(shí)候一般會(huì)用異丙醇沉淀。不過(guò)感覺(jué)效果不如乙醇,偶爾會(huì)有沉淀不出來(lái)東西的時(shí)候?!?00ul的水相對(duì)應(yīng)500ul的的異丙醇?!?醇沉淀是很經(jīng)常用的方法,因?yàn)镽NA和某些雜質(zhì)不溶于異丙醇,所以可以用來(lái)沉淀。
乙醇沉淀的主要目的是沉淀+除鹽。 TRIzol主要物質(zhì)是異硫氰酸胍,它可以破壞細(xì)胞使RNA釋放出來(lái)的同時(shí),保護(hù)RNA的完整性 。加入氯仿后離心,樣品分成水樣層和有機(jī)層。RNA存在于水樣層中。收集上面的的水樣層后,RNA 可以通過(guò)異丙醇沉淀來(lái)還原。 無(wú)論是人、動(dòng)物、植物還是細(xì)菌組織,TRIzol法對(duì)少量的組織(50-100 mg)和細(xì)胞(5×106)以及大量的組織(≥1 g)和細(xì)胞(>107)均有較好的分離效果。TRIZOL試劑操作上的簡(jiǎn)單性允許同時(shí)處理多個(gè)的樣品。所有的操作可以在一小時(shí)內(nèi)完成。TRIZOL抽提的總RNA能夠避免DNA和蛋白的污染。故而能夠作RNA 印 跡分析、斑點(diǎn)雜交、poly(A)+ 選擇、體外翻譯、RNA酶保護(hù)分析和分子克隆。
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