WB實驗干貨-實驗介紹、蛋白提取、蛋白定量
一、WB實驗介紹
WB(Western Blot,蛋白免疫印跡)是一種常規(guī)的蛋白分析技術(shù),常用于鑒定某種蛋白,并能對蛋白進行定性和半定量分析。
WB實驗的基本核心理念是抗原抗體的特異性反應(yīng),通過變性膠 SDS-PAGE 將不同分子量的蛋白質(zhì)分離開,然后轉(zhuǎn)移到固相載體 PVDF 膜上,再用脫脂牛奶作為封閉液進行封閉和一抗稀釋液進行稀釋。待目的蛋白和抗體充分結(jié)合后,用 TBST 洗脫液洗脫掉多余未結(jié)合的一抗,加入帶有 HRP 標記的對應(yīng)二抗,這樣,我們的蛋白+一抗+二抗形成一個復(fù)合物,加以化學發(fā)光液,有靶蛋白的位置就會產(chǎn)生熒光,利用膠片或者化學發(fā)光儀就可以顯現(xiàn)靶蛋白的條帶顯現(xiàn)。
WB常規(guī)實驗流程:蛋白提取→蛋白定量→制膠→電泳→轉(zhuǎn)膜→封閉→一抗孵育→一抗洗脫→二抗孵育→二抗洗脫→化學發(fā)光→數(shù)據(jù)分析。
二、WB實驗試劑配置
在實驗開始之前,可以按以下配方比例配置實驗所需試劑。
1.電泳緩沖液
取 電泳緩沖液干粉(G2018-1L),溶解于 1L 純水(G4701-500ML)中,置于磁力攪拌器(MS-150)上攪拌充分溶解。
2. 轉(zhuǎn)膜緩沖液
取 轉(zhuǎn)膜緩沖液干粉(G2017-1L),溶解于 800mL 純水中,加入 200mL 的甲醇,置于磁力攪拌器上攪拌充分溶解。
3. TBST 緩沖液
取 TBS 粉劑(G0001-2L),溶解于 2L 純水中,加入 1mL 吐溫20,置于磁力攪拌器上攪拌充分溶解。
4. 5%脫脂牛奶
稱量 5g 脫脂奶粉(G5002-100G),溶解于 100mL TBST 溶液(G0004-500ML)中,置于磁力攪拌器上攪拌至少 30分鐘,然后放入 4℃冰箱暫放。
5.完全裂解液
1mL RIPA 裂解液(G2002-100ML或G2033-100ML)+20μL cocktail(G2006-250UL)+10μL磷酸化蛋白酶抑制劑 A(G2007-1ML)+10μL 磷酸化蛋白酶抑制劑 B(G2007-1ML)+10μL PMSF(G2008-1ML),除 RIPA 外,其他四種試劑使用前幾分鐘加入,現(xiàn)配現(xiàn)用。
三、WB實驗步驟
由于文章篇幅限制,小賽這次先介紹組織或細胞的蛋白提取和蛋白定量常規(guī)流程。
蛋白提取
1 .組織總蛋白提取
準備好所需要數(shù)量的樣本管;放入研磨珠,置于冰盒上備用;
組織塊先用預(yù)冷 PBS洗滌 2-3 次,除去血污,然后放在濾紙上,吸盡多余的 PBS 后放入對應(yīng)的勻漿管中,加入大約 10 倍樣本體積的完全裂解液,置于組織研磨儀中,對稱放置,確認放置平衡后,蓋好蓋子,選擇程序開始勻漿。
Tips
① 芝麻大小的組織,一般加入100-200μL 完全裂解液;綠豆大小組織加入 400-600μL 完全裂解液;黃豆大小組織加入 800-1000μL完全裂解液。
② Servicebio三維研磨儀參考參數(shù):2mm 氧化鋯珠 8-12顆,頻率6.5m/s,時間30s。如果一次勻漿不徹底,可以再次勻漿)。如果組織塊比較大,可提前用剪刀將組織塊剪碎。
2 懸浮細胞提取蛋白
將細胞連帶培養(yǎng)基一起吸入 15mL 離心管(EP-1501-J)中,4℃,2000rpm,離心 5分鐘,去掉上清;
加入 1mL PBS 溶液(G4202-500ML)重懸細胞,將細胞轉(zhuǎn)移到 1.5mL 離心管(EP-150-M)中,然后 4℃,2000rpm,離心 5分鐘,去掉上清,保留沉淀,重復(fù)此步驟 2-3 次(此步驟目的為清洗細胞中殘留的培養(yǎng)基);
根據(jù)細胞沉淀的量加入適量的完全裂解液,例如沉淀體積為綠豆大?。ù蟾?10uL 左右)的加入大約 200μL 完全裂解液,加入適量研磨珠,放入研磨儀進行裂解;
裂解完成后,12000rpm,4℃,離心 10分鐘,上清即為總蛋白溶液。
3 貼壁細胞提取蛋白
倒掉培養(yǎng)基,沿細胞培養(yǎng)皿側(cè)壁或者培養(yǎng)瓶瓶口慢慢加入 PBS 溶液,輕輕晃動平皿或者培養(yǎng)瓶,然后將細胞培養(yǎng)皿/瓶傾斜放置,用移液槍輕輕吸除殘余液體,盡量輕柔,不要將細胞沖掉,清洗 2-3 次,最后一次將殘余 PBS 完全吸干;
加入適當體積的完全裂解液(例如六孔板各單孔細胞長滿的話,加入大約 250μL完全裂解液),反復(fù)晃動細胞培養(yǎng)皿/瓶,讓裂解液與細胞完全接觸,用細胞刮刀將細胞刮下來,收集后,加入研磨珠,放入研磨儀中進行裂解;
裂解完成后,12000rpm,4℃,離心 10分鐘,上清即為總蛋白溶液。
蛋白定量
取適量上述步驟中未變性的總蛋白溶液,用 BCA 蛋白定量檢測試劑盒(G2026-200T;G2026-1000T)測蛋白濃度,蛋白濃度測定方法如下:
A.配制蛋白標準貯備液
取1 mL蛋白標準配制液加入到蛋白標準品(BSA)蛋白標準管中,將25 mg蛋白標準品完全溶解,即得到濃度為25 mg/mL的蛋白標準貯備液。配制成的蛋白標準溶液可-20℃長期保存。
B.配制蛋白標準工作液
取適量25 mg/mL蛋白標準貯備液,用PBS或生理鹽水稀釋50倍,得到終濃度為0.5 mg/mL的蛋白標準工作液。注意稀釋時按照10倍梯度方法稀釋,確保稀釋準確。
C.繪制標準曲線(酶標儀法)
將蛋白標準工作液分別按0、1、2、4、8、12、16、20 μL加到96孔板中,然后用PBS或生理鹽水依次加20、19、18、16、12、8、4、0 μL將上述梯度工作液補足到20 μL。得到蛋白濃度依次為0、25、50、100、200、300、400、500 μg/mL的梯度曲線。
D.準備待測樣品
將待測的蛋白樣品進行適當稀釋(可通過預(yù)實驗檢測,使樣品蛋白濃度在標準曲線范圍內(nèi),確保檢測結(jié)果可信),按照每個樣品20 μL的量加到96孔板中。待測樣品與蛋白標準品用相同溶液稀釋。
E.配制BCA顯色工作液
將BCA試劑與硫酸銅溶液按照50:1體積比充分混合均勻,得到BCA顯色工作液。BCA顯色工作液可室溫保存,24 h內(nèi)使用。每個待測樣品需200 μL,建議按需配制,避免浪費。
F.檢測
向標準曲線樣品孔及待測樣品孔中每孔加入BCA顯色工作液200 μL,充分混勻(可將96孔板放在振蕩器上振蕩30 s),37℃反應(yīng)30 min后,以標準曲線0號做參比,在562 nm波長下比色測定,記錄各孔吸光度值。(注:也可以在室溫反應(yīng)2 h,或60℃反應(yīng)30 min。如果蛋白濃度較低,建議置于60℃反應(yīng))
G.計算
以標準曲線中梯度蛋白含量(μg/mL)為橫坐標,吸光值為縱坐標,繪出標準曲線。根據(jù)所測樣品的吸光值,在標準曲線上即可查得相應(yīng)孔中待測樣品的蛋白濃度(μg/mL),再乘以樣品稀釋倍數(shù)即為待測樣品實際蛋白濃度。
Tips
1. BCA法測定蛋白濃度受溫度和時間的影響較大,吸光度值會隨著時間的延長或溫度升高而變化,如果不能精確控制顯色反應(yīng)的時間和溫度,建議每次測定都需要做標準曲線。
2. 在進行蛋白標準貯備液的配制時,需確保溶解充分。稀釋配制蛋白標準工作液時建議10倍梯度稀釋,不要一次稀釋50倍,以免產(chǎn)生較大誤差。
3. 為保證蛋白的精確定量,樣品的提取和蛋白標準品的稀釋配制最好選用相同的緩沖液,同保證兩者檢測條件一致。如果緩沖液本身就有較高的背景值,建議使用其他的方法測定。
4. 操作時請穿實驗服,并佩戴一次性手套。
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